Los hidroximetilomas del cáncer colorrectal

El cáncer colorrectal (CRC) sigue siendo uno de los problemas mayoritarios de salud a nivel mundial. Su alta tasa de mortalidad está ligada a su diagnóstico tardío y, por tanto, sigue siendo crucial el desarrollo de biomarcadores útiles para su detección temprana. Las alteraciones epigenéticas son clave tanto en el inicio como en la progresión de esta enfermedad. En este contexto, el reciente descubrimiento de la 5-hidroximetilcitosina (5hmC) está cambiando nuestra visión del epigenoma del CRC. En este proyecto planteamos la determinación de los hydroximetilomas completos del CRC, la evaluación del potencial de las alteraciones como posibles marcadores clínicos y el estudio de de las consecuencias funcionales. Para ello, utilizaremos técnicas de oxidación del DNA puestas recientemente a punto en nuestro laboratorio que permiten distinguir entre 5hmC y 5-metilcitosina (5mC), utltrasecuencion del DNA y arrays de metilación. Los genes identificados serán validados mediante secuenciación de bisulfito en series independientes de pacientes. En varios candidatos, estudiaremos el efecto de los cambios en 5hmC sobre las expresión génica y llevaremos a cabo estudios in vitro e in vivo para determinar las consecuencias funcionales de dichos cambios sobre el proceso tumoral. Finalmente, analizaremos DNA obtenido de suero de pacientes con CRC y sanos para determinar si los marcadores moleculares identificados en los tumores también se detentan en sangre periférica, facilitando por tanto su utilización en la práctica clínica.